專利行政訴訟，主要是指針對(duì)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局及其專利復(fù)審委的審查決定提起的訴訟，還包括部分針對(duì)各省市專利局對(duì)假冒、冒充專利的行政處罰而提起的訴訟，因?yàn)楹笠活愋姓V訟除在管轄方面的特殊規(guī)定以外，其他方面與一般的行政訴訟相同，所以，在此分析的特點(diǎn)主要是指前一類專利行政訴訟案件。
一、被告相對(duì)固定
在針對(duì)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局及其專利復(fù)審委的專利行政訴訟中，被告相對(duì)固定，而根據(jù)行政訴訟管轄權(quán)的規(guī)定，其管轄法院也固定為北京市第一中級(jí)人民法院，每年在北京市一中院進(jìn)行的專利行政訴訟有幾百起。
二、審理范圍以行政決定的范圍為限
專利行政訴訟，首先具有行政訴訟的特點(diǎn)，行政訴訟要求法院的審理范圍以行政決定的范圍為限，對(duì)行政處理未涉及的問(wèn)題，即使原告人請(qǐng)求法院一并審理，人民法院也不能審理，更不能一攬子作出判決，因?yàn)樾姓C(jī)關(guān)未進(jìn)行審查，法院當(dāng)然不能審理其審查行為是否正確。
三、一般只審查具體行政行為的合法性
行政訴訟要求法院只對(duì)被告具體行政行為的合法性進(jìn)行審查，即只能對(duì)被告的審查行為作出正確與否的判斷，不能代替被告進(jìn)行審查，所以，如果法院認(rèn)為被告的審查行為不合法，一般應(yīng)當(dāng)撤銷，由被告重新作出審查決定。合法性原則在少數(shù)情況下有例外，即在少數(shù)有法律明確規(guī)定的情況下，法院可以審理行政行為的合理性，進(jìn)行相應(yīng)的變更審查結(jié)果的判決?，F(xiàn)在專利行政訴訟中也規(guī)定了這個(gè)例外，針對(duì)法院撤銷行政決定后，復(fù)審委在對(duì)案件重新審查時(shí)周期較長(zhǎng)的現(xiàn)象，法律中增加了對(duì)專利無(wú)效審查的合理性進(jìn)行審理的權(quán)力，也就是法院可以在判決中判定專利權(quán)是否有效，所以，當(dāng)事人可以向法院提出這樣的訴訟請(qǐng)求。
四、涉及知識(shí)面廣
專利行政訴訟，還會(huì)在訴訟中涉及到專業(yè)的技術(shù)知識(shí)，并要求將這些技術(shù)事實(shí)解釋為專利法律適用的事實(shí)，對(duì)參與訴訟的當(dāng)事人知識(shí)要求頗高，不僅要求當(dāng)事人具備相應(yīng)的技術(shù)知識(shí)基礎(chǔ)，還要求當(dāng)事人具備訴訟所需要的法律思維。
五、法院審理專利行政訴訟的法律依據(jù)。
專利法及其實(shí)施細(xì)則和相關(guān)的司法解釋，行政訴訟方面的法律法規(guī)及司法解釋，都是法院審理專利行政訴訟的法律依據(jù)。一般人認(rèn)為，《審查指南》也是法院審理專利行政訴訟的法律依據(jù)，事實(shí)上，《審查指南》只是國(guó)務(wù)院部門的規(guī)章級(jí)別的規(guī)定，按照《行政訴訟法》，法院對(duì)《審查指南》只是“參照”，不是“依據(jù)”，“參照”即要求法院在適用前要審查該規(guī)章是否正確，對(duì)于正確的規(guī)章必須適用。所以，在專利訴訟中要注意更多的理解運(yùn)用專利法以及專利法的法理，對(duì)《審查指南》的運(yùn)用要注意是否與專利法的法理相矛盾。
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