1、行使馳名商標認定權(quán)的主體不同。根據(jù)新《認定和保護規(guī)定》第四條、第八條以及《商標法實施條例》第四十五條的規(guī)定,行使馳名商標行政認定權(quán)的是商標局和商標評審委員會。根據(jù)《審理商標民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第二十二條和《審理涉及計算機網(wǎng)絡(luò)域名民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第六條的規(guī)定以及2001年12月25日最高人民法院審判委員會第一千二百零三次會議通過的《最高人民法院關(guān)于審理商標案件有關(guān)管理和法律適用范圍問題的解釋》第二條第三款的規(guī)定,行使馳名商標司法認定權(quán)的是中級以上的各級人民法院。

2、馳名商標行政認定權(quán)和司法認定權(quán)的效力,在不同個案中相同,在同一個案中司法認定權(quán)的效力高于行政認定權(quán)的效力。

3、適用范圍不同。商標局或商標評審委員會既可以對被申請的注冊商標又可以對被申請的未注冊商標是否馳名進行認定。而根據(jù)《審理商標民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第二十二條以及《審理涉及計算機網(wǎng)絡(luò)域名民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第六條的規(guī)定,人民法院僅僅可以對注冊商標是否馳名進行認定而不能對未在中國注冊的商標是否馳名進行認定,這與我國奉行“注冊取得原則”從而側(cè)重保護注冊商標相一致,但有違“司法最終審查原則”。