一、怎么計(jì)算加班費(fèi)？

《上海市企業(yè)工資支付辦法》第九條之規(guī)定，假期工資的計(jì)算基數(shù)按以下原則確定：勞動合同有約定的，按不低于勞動合同約定的勞動者本人所在崗位（職位）相對應(yīng)的工資標(biāo)準(zhǔn)確定。

同時(shí)，上海市高級人民法院《民一庭調(diào)研與指導(dǎo)》民一庭調(diào)研指導(dǎo)【2010】34號明確規(guī)定：用人單位與勞動者對月工資有約定的，加班工資基數(shù)應(yīng)按雙方約定的正常工作時(shí)間的月工資來確定；如雙方對月工資沒有約定或約定不明的，應(yīng)按《勞動合同法》第18條規(guī)定來確定正常工作時(shí)間的月工資，并以確定的工資數(shù)額作為加班工資的計(jì)算基數(shù)。

綜上所述，根據(jù)上述法律規(guī)定，加班工資基數(shù)應(yīng)當(dāng)按照用人單位與勞動者約定的正常工作時(shí)間月工資確定。

因此，用人單位在規(guī)章制度中規(guī)定的加班工資基數(shù)低于上述標(biāo)準(zhǔn)，那么違反法律的強(qiáng)制性規(guī)定，屬于無效的條款；用人單位應(yīng)當(dāng)按照法律規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)補(bǔ)足加班費(fèi)差額部分。

二、加班費(fèi)差額如何舉證？

根據(jù)現(xiàn)行法律規(guī)定：

（1）應(yīng)當(dāng)由勞動者提供證據(jù)材料證明其存在加班的事實(shí)；比如工資單、考勤卡。

（2）如果勞動者證明相關(guān)的證據(jù)材料由單位掌握，那么單位應(yīng)當(dāng)提供。根據(jù)現(xiàn)行的法律規(guī)定，用人單位有義務(wù)提供員工離職前2年內(nèi)的工資單備查。如果單位不提供，將承擔(dān)不利的法律后果。

若勞動者沒有保留工資單，則用人單位需要提供兩年的工資單，勞動者只能獲得就這兩年的加班工資差額部分。

該公司的《員工手冊》長時(shí)間未進(jìn)行修改，勞動合同法在司法實(shí)踐中法律變化很快，上海市高級人民法院內(nèi)部指導(dǎo)意見專門對這個問題進(jìn)行了說明，明確了合同中對工資有約定的，應(yīng)當(dāng)按照工資來支付加班費(fèi)，具體的內(nèi)容與一審法院中判決寫明的理由相同。因此，作為用人單位應(yīng)當(dāng)掌握最新的勞動法律，并根據(jù)法律的變化及時(shí)修改相應(yīng)的規(guī)章制度，避免相應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。