司法賠償?shù)恼埱蠛徒鉀Q方式比較特殊，它不是通過向人民法院起訴進行的。具體來說，可以分為三個程序：

第一，違法行為確認程序。賠償請求人向賠償義務機關提出請求，義務機關診法對其違法行為進行確認，并作出賠償。司法行為違法的確認是提出司法賠償?shù)那疤??！?a href="http://www.luxwatt.cn/flcs/list_41.html" target="_blank" class="keywordlink">國家賠償法》第15、16條規(guī)定了司法行為違法的具體情形，賠償義務機關接受賠償請求后進行審查，在收到申請之日起2個月內，對于符合法定賠償條件的，可以依法就賠償方式和數(shù)額與申請人進行協(xié)商，協(xié)商不成的也可單方面作出處理決定。

第二，司法賠償復議程序。申請人如果對上述裁決不服或未達成協(xié)議的，有權向賠償義務機關的上一級機關提出復議申請，由復議機關進行審查并在收到申請之日起 2個月內作出處理決定。此程序僅適用于公安機關安全機關和監(jiān)獄管理機關作出義務機關的情況，對人民法院作為賠償義務機關的情形則不適用。

第三。司法賠償決定程序。中級以上人民法院設立賠償委員會，負責司法賠償問題的最終解決。復議機關逾期不作出復議決定或者受害人對復議決定不服的，應當向與復議機關同級的人民法院賠償委員會提出申請。賠償委員根據(jù)不同的情形可以作出維持決定、撤銷決定、變更決定、賠償決定或不予賠償?shù)臎Q定。